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Ketoconazol, Itraconazol
Aufgrund der profunden und langanhaltenden Inhibierung der Magensäureproduktion kann Pantoprazol die Resorption von Arzneimitteln herabsetzen, deren Bioverfügbarkeit pH-abhängig ist, wie z.B. diejenige von Azol-Antimykotika (Plumb 2015a; Schaefer 2013a).
Sucralfat
Sucralfat kann die Bioverfügbarkeit von oral appliziertem Pantoprazol senken (Plumb 2015a).